На главную страницу первого семестра

ИЗОЦИТРАТДЕГИДРОГЕНАЗА

 Краткое название белка—IDH_ECOLI
  • Полное название организма—Escherichia coli, К - 12
  • Название гена—icd
  • Номер локуса в бактериальной хромосоме—b1136
  • Последовательность аминокислотных oстатков в FASTA 
    >IDH_ECOLI.   
MESKVVVPAQGKKITLQNGKLNVPENPIIPYIEGDGIGVDVTPAMLKVVDAAVEKAYK
GERKISWMEIYTGEKSTQVYGQDVWLPAETLDLIREYRVAIKGPLTTPVGGGIRSLNV
ALRQELDLYICLRPVRYYQGTPSPVKHPELTDMVIFRENSEDIYAGIEWKADSADAEK
VIKFLREEMGVKKIRFPEHCGIGIKPCSEEGTKRLVRAAIEYAIANDRDSVTLVHKGN
IMKFTEGAFKDWGYQLAREEFGGELIDGGPWLKVKNPNTGKEIVIKDVIADAFLQQIL
LRPAEYDVIACMNLNGDYISDALAAQVGGIGIAPGANIGDECALFEATHGTAPKYAGQ
DKVNPGSIILSAEMMLRHMGWTEAADLIVKGMEGAINAKTVTYDFERLMDGAKLLKCS
EFGDAIIENM

    Мои вычисления с помощью Excel

     Аминокислотный состав белка IDH_ECOLI:
    A(Аланин) 9.13%
    C(Цистеин) 1.44%
    D(Аспарагиновая кислота) 6.01%
    E(Глутаминовая кислота) 8.41%
    F(Фенилаланин) 2.40%
    G(Глицин) 9.62%
    H(Гистидин) 1.20%
    I(Изолейцин) 8.89%
    K(Лизин) 7.45%
    L(Лейцин) 7.45%
    M(Метионин) 3.12%
    N(Аспарагин) 3.61%
    P(Пролин) 4.81%
    Q(Глутамин) 2.64%
    R(Аргинин) 4.09%
    S(Серин) 3.12%
    T(Треонин) 4.43%
    V(Валин) 7.21%
    W(Триптофан) 1.44%
    Y(Тирозин) 3/61%
    Длина последовательности — 416 а.о.
    Молярная масса — 45749.82 г/моль
    Средний заряд молекулы при рН=7.0 — -11.6023
    Отношение содержания гидрофобных остатков
    • Аланин
    • Цистеин
    • Фенилаланин
    • Изолейцин
    • Лейцин
    • Метионин
    • Валин
    к содержанию гидрофильных
    • Аспарагин
    • Глутамин
    • Гистидин
    • Лизин
    • Аспарагиновая кислота
    • Глутаминовая кислота
    • Аргинин
    • Серин
    — 0.92121, что позволяет думать, что данный белок не является мембранным
    © Волкова Екатерина,2004